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Brochure 2020
在個人化基因體重新組裝部分,將與中研院生物醫學研 圖二:利用我們所發展的策略來精進個人化基因體組裝品質,邁向
究所團隊合作,整合 10x Genomics 與 bionano 光學測繪 未來精準醫療。
的大量資料 ( 一個人約有超過 100Gb 以上的數據 ),來發
展新一代雲端組裝演算法,建構高品質個人基因體。目
前已能有效地將原有組裝之遺缺 (Gaps) 部分大幅縮減,
並增加序列長度與基因內容,也就是提昇整體組裝的解
析度與質量。將能作為未來結合人工智慧與相關醫療資
料後,發展精準醫療的重要紮實基礎 ( 圖二 )。同時,為
了解決大量運算所造成的計算需求,在高效率雲端計算
流程建構部分,研發團隊將與台灣微軟公司一同合作開
發。
本研究之相關成果也陸續整理釋出程式源碼及建構 國際研討會與舉辦工作坊的方式,以及一年一度的院區
開放日來宣傳與推廣。讓更多院內外的生物醫學研究社
Dockers images, 放 置 在 GitHub 及 Docker Hub (https:// 群得以善用這些工具,更深入他們自身的研究主題。此
hub.docker.com/u/lsbnb) 上。組裝出來的經濟生物基因 外,研發成果中的『人類與小鼠基因表現分析平台』,已
體,也透過研發團隊所建構的平台,進行註解與線上資 與國內定序廠商合作。以技術授權的方式完成轉移威健
料庫建構,將這一些非模式物種之基因體研究,提昇到 生物科技股份有限公司,於 2018 年底開始商業試運轉。
如同果蠅或小鼠等模式生物的水準,協助相關研究社群
進行更詳盡的研究 ( 圖三、四 )。同時,我們也透過參與
圖三:將非模式物種之基因體研究推至模式生物的架構。
圖四:基因體分析應用程式,及多個重要物種之線上資料庫平台,可透過 QR codes 連結網站。
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在個人化基因體重新組裝部分,將與中研院生物醫學研 圖二:利用我們所發展的策略來精進個人化基因體組裝品質,邁向
究所團隊合作,整合 10x Genomics 與 bionano 光學測繪 未來精準醫療。
的大量資料 ( 一個人約有超過 100Gb 以上的數據 ),來發
展新一代雲端組裝演算法,建構高品質個人基因體。目
前已能有效地將原有組裝之遺缺 (Gaps) 部分大幅縮減,
並增加序列長度與基因內容,也就是提昇整體組裝的解
析度與質量。將能作為未來結合人工智慧與相關醫療資
料後,發展精準醫療的重要紮實基礎 ( 圖二 )。同時,為
了解決大量運算所造成的計算需求,在高效率雲端計算
流程建構部分,研發團隊將與台灣微軟公司一同合作開
發。
本研究之相關成果也陸續整理釋出程式源碼及建構 國際研討會與舉辦工作坊的方式,以及一年一度的院區
開放日來宣傳與推廣。讓更多院內外的生物醫學研究社
Dockers images, 放 置 在 GitHub 及 Docker Hub (https:// 群得以善用這些工具,更深入他們自身的研究主題。此
hub.docker.com/u/lsbnb) 上。組裝出來的經濟生物基因 外,研發成果中的『人類與小鼠基因表現分析平台』,已
體,也透過研發團隊所建構的平台,進行註解與線上資 與國內定序廠商合作。以技術授權的方式完成轉移威健
料庫建構,將這一些非模式物種之基因體研究,提昇到 生物科技股份有限公司,於 2018 年底開始商業試運轉。
如同果蠅或小鼠等模式生物的水準,協助相關研究社群
進行更詳盡的研究 ( 圖三、四 )。同時,我們也透過參與
圖三:將非模式物種之基因體研究推至模式生物的架構。
圖四:基因體分析應用程式,及多個重要物種之線上資料庫平台,可透過 QR codes 連結網站。
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